農委會昨天（4/1）公布針對遠洋漁船，境外聘用外籍船員的入境防疫措施，船隻過去30天內如果有進入他國港口等情形，境外聘用的外籍船員需待在船上「原船檢疫」14天。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中今（4/2）表示，原船檢疫主要是要讓外籍船員與本土社會作出區隔，至於船隻生活環境比較差的問題，陳時中表示會再和勞動部、漁業署討論。

台灣自3月19日起全面境管，入境者一律皆需居家檢疫14天，至今剛滿兩週。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中今天（4/1）表示，接下來防疫重心將放在居家檢疫上。指揮中心宣布，居家檢疫者只要一違規擅離居所，將直接送往集中檢疫所安置；同時交通部觀光局也對「防疫旅舍」補助一房一天1,000元，鼓勵設立防疫旅舍。

昨日（3/31），醫療院所工作人員採檢新制正式上路，「擴大採檢」只要二採陰、且經醫師評估後，即可回復上班，指揮中心表示這是為了避免醫院人力緊縮，且可避免醫護撐著不就醫；台灣護師醫療產業工會理事長陳玉鳳對此表示，此措施可讓醫護不用一採檢、就十四天不能上班，對醫護人員來說確實有些好處，但這項措施著重點還是醫院人力問題，目前防疫措施，並未從醫護人員權益出發，相關措施的擬定，也未徵詢基層一線人員的意見。

日前衛福部次長薛瑞元預告，醫療院所工作人員若為「擴大採檢」，可在二次採驗結果陰性後返回工作，不須向過去14天無法工作，昨日（3/31）此制度正式開始執行；薛瑞元預告時說明，這可避免醫療院所面臨人力緊縮的問題，昨日衛福部醫事司司長石崇良進一步表示，這可以避免醫護人員撐著不就醫的情況。

中央流行疫情指揮中心專家諮詢小組召集人張上淳今天（3/31）表示，將擴大病毒採檢對象的標準，「嗅覺、味覺異常」被列為武漢肺炎的臨床症狀條件，醫師診斷時若發現有症狀、同時有外國遊遊史等情況，需通報案例並安排採檢；同時對於有「肺炎」症狀者，張上淳表示希望通通送驗。

從3月18號，空勤組員檢疫措施交到民航局手上之後，十天以來，中央疫情指揮中心每次解釋，聽起來都不大一樣，而昨天晚上，民航局發佈「補充管理原則」，確定組員返國後，貨機三天、客機五天不得外出，才終於主動對外發稿，並且參加今天（3/28）指揮中心的記者會說明。

勞動部長許銘春日前表示，若經濟部認定受疫情衝擊的產業有需要，在復原重建期可根據《勞基法》放寬勞工加班工時、國定假日、例假等限制。勞動條件司副司長黃維琛接受專訪說明，《勞基法》原本就有第32條例外與第40條，有事變時可放寬加班、例假日等限制。黃維琛表示，勞動部同意的是大原則，實際上仍由地方勞動機關認定、把關。

中央流行疫情指揮中心開放航空業，對於入境的空勤組員採特別管理方式。指揮中心曾表示，航空公司有一個「完整的計畫」來進行飛勤防疫，但對於計畫內容，幾次記者會上的說明都不太一致。「完整的計畫」到底寫了什麼？民航局表示，這是內部文件，暫不公開；指揮中心副指揮官、內政部次長陳宗彥對此則表示，不解為何不能，應該可以提供。

接連兩日，陸續報出華航2名貨運機師、以及1名長榮空服員、1名非我國航空公司空服員確診的訊息，疾管署副署長莊人祥表示，這些案例皆是航空業採取特別措施前即入境的案例。3月18日後入境的飛勤人員，外出、生活等管理由航空公司與民航局管理，是否有破口的疑慮，莊人祥說將會再觀察一陣子，若有必要就調整。

3月23日起，各縣市相關窗口開始受理「武漢肺炎隔離補償」的申請。衛福部社工司司長楊錦青說明，包括受隔離、檢疫者，以及相關必要照顧者，若個離期間未違反相關規則、也未受領薪資，可以申請領取每天1,000元的補償金；至於在3月17日後非必要出國者，楊錦青表示這不符補償設立意旨，不予補償，這也是指揮中心第一次說明「無故出國不給補償」的依據。