臺灣中小企業銀行（簡稱台企銀）1998年民營化，2004政府開始二次金改期間，欲在2005年底前，將12家公股金融機構數目至少減為6家，達成金融整併的目標，便著手計畫標售台企銀。當時幾年間金融業的併購案例，被併銀行的員工會遭受到金控財團銀行逼退，接下來就得面對長期失業、專業報廢的窘境，台企銀工會為了維護工作權，在勞資爭議調解失敗後，決定進行罷工。
標售台企銀的決策和過程皆不透明，讓員工有極深的危機感，擔心被併購後將工作不保，員工不要幾n加幾的年資補償金方案，他們要求保障工作權，台企銀在1998年民營化後，年資結清重新起算，所有員工的年資最高不超過8年，幾年的年資補償金根本補償不了專業員工在離職後未來可能面臨的長期失業，這分不穩定感是台企銀員工奮起罷工的主因。2005年8月27日舉行臨時會員大會，總計4500名工會會員中，有3619人投票，其中3467票贊成罷工，同日並舉行「反合併、要專業」大遊行，提出「反對公股以換股方式規避立法院監督」、「反對在《銀行法》第96條未修改前提出合併案」、「反對在團體協約簽訂前就執行合併案」三項訴求。
2005年9月8日早上罷工開始，台企銀為台灣罷工史寫下重要的一頁，工會估計參與罷工的會員超過5成，資方一度宣稱只有3成，稍晚又改口4成。雖有一些員工被迫留下上班，但也在位置上掛著「罷工」標語，毫不諱言支持罷工行動。
9日，罷工現場估計已經超過2200 人，越演越烈的情況下，即傳出標售「暫無結果」，台企銀臨時董事會取消，時任行政院秘書長李應元同意會同財政部、勞委會、經建會及工會一起研商工會版團體協約。由於當天是星期五，李應元希望星期一與工會研商時員工可以復工，但經過罷工會員的集體決策，大家認為如果沒有罷工作為籌碼，工會與官資談判會失去優勢，經過絕大部分員工舉手投票決議12日星期一繼續罷工。10日適逢週六，一般中小企業的發薪日會順延到9月12日，發薪是銀行最忙碌的日子，若維持住這兩天的罷工人數，將給銀行帶來極大壓力。
12日罷工人數持續增加，當天員工紛紛喊要「廢標」、反合併，要求財政部宣布暫緩標售，但財政部表示已經非其權責，需要立院做出決議，希望工會能在明天立院開議後向立委遊說，工會則預計13日轉戰立院擋下標售案。李應元邀集時任財政部部長林全、勞委會副主委賴勁麟、全產總理事長鍾孔炤、全聯會理事長黃水泉、台企銀工會理事長林萬福等人，就工會版團體協約進行3小時協商。林全說會把工會的員工權益保障方案轉達給潛在買方，請其出價前一併考量，但無約束力，潛在買方如果出了滿意的價格，台企銀標案仍會成交。也就是台企銀標售成功與否，已經與團體協約脫勾。有可能團體協約簽署後，因為價格太高而流標，也有可能決標後，在與工會簽訂團體協約。台企銀工會理監事經過討論並記名投票，25名理監事中，21名贊成簽訂團體協約及優惠退職專案。不過理監事將決定公開告知罷工集合現場的員工時，引發員工的不滿。堅持反合併的員工不希望工會簽署團體協約。
13日工會將罷工隊伍拉到立院，遊說立委要求財政部撤銷併購，並輔導成為中小企業專業銀行。適逢立院開議，院內亂成一團，立委吵成一團，場外抗議的台企銀勞工，也大聲喊出「反合併、要專業、反財閥」的口號。台企銀工會幹部在中午左右結束遊說，開始討論下一步行動，9月13日下午，工會宣布暫停持續共4天的罷工，等待財政部的決標結果後，在決定是否發動二次罷工。
在暫停罷工隔天，9月14日晚上，財政部長林全開記者會宣布台企銀標售案流標，並認為台企銀工會不斷提出新的要求，造成潛在買方放棄出價是流標主因之一。9月16日，台企銀董事長鍾甦生因標售案流標而請辭。同樣受到二次金改影響的多家公股銀行工會也陸續在此事件發售後完成罷工投票，包括第一商業銀行、中國國際商業銀行（2005年11月第一銀行與中商銀同時投票通過）、台北國際商業銀行（2006年1月投票通過）、台中商業銀行（2006年3月投票通過）以及華僑銀行（2006年5月投票通過）等，但除了台灣企銀之外均未進行實質罷工。