- 稻米國別配額（Country-Specific Quota，CSQ）天花板價格透明化
- 2025年報告：批評台灣的天花板價格機制不公開，價格被任意壓低導致標案失敗。
- 2026年報告：新增說明台灣在協定下已承諾向美國提供天花板價格及計算方法，並回應美方疑慮。
- 協定條文：Art. 2.1.3註釋。
貿易障礙報告（National Trade Estimate Report，NTE）英文原文使用「天花板價格（ceiling price）」，協定官方中文文本對應用語為「底價（reserve price）」，指招標底價，非市場上限價格）。
- 豬肉檢查歧視
- 2025年報告：台灣無故針對美國豬肉業者（進口商、經銷商、餐飲業者）頻繁檢查，干擾正常營運。
- 2026年報告：新增協定承諾，台灣將給予美國豬肉不低於本地或第三國豬肉的待遇，包括檢查頻率。
- 協定條文：Art. 3.3 para 25-27, 32。
- 汽車FMVSS數量限制
- 2025年報告：台灣將符合美國FMVSS標準的車輛限制在每車型75輛。
- 2026年報告：新增協定承諾，台灣將取消數量限制，接受符合FMVSS和排放標準的美國車輛。
- 協定條文：Art. 2.2.2（取消配額）、Art. 3.2.6（六個月內接受FMVSS車輛）。
- 牛肉及牛肉產品禁令
- 2025年報告：台灣以牛海綿狀腦病變（Bovine Spongiform Encephalopathy，BSE）為由禁止部分美國牛肉產品（如絞牛肉），並實施繁瑣的港口入境檢驗。
- 2026年報告：新增協定承諾，台灣將不採取與世界動物衛生組織（World Organisation for Animal Health，WOAH）準則不一致的措施，解除禁令並取消繁瑣檢驗程序。
- 協定條文：Art. 3.3 para 9-20註釋。
含取消逐箱檢查、取消解凍檢查、接受食品安全檢查署（Food Safety and Inspection Service，FSIS）食品安全檢查署的肉品、禽肉及蛋品檢查合格工廠名錄（Meat, Poultry, and Egg Product Inspection ）、禁止設施登記要求等12項細則。
- 動物副產品（牛血製品、散裝牛脂）
- 2025年報告：台灣以牛海綿狀腦病變為由限制美國牛血製品及散裝牛脂進口。
- 2026年報告：新增協定承諾，台灣將不維持與世界動物衛生組織準則不一致的進口限制。
- 協定條文：Art. 3.3 para 35。
- 萊克多巴胺最大殘留容許量（Maximum Residue Limit，MRL）
- 2025年報告：台灣未對牛肉內臟（肌肉以外）採用Codex最大殘留容許量；豬腎最大殘留容許量比Codex嚴格；檢測方法不符聯合食品添加物專家委員會（Joint FAO/WHO Expert Committee on Food Additives，JECFA）標準。
- 2026年報告：新增協定承諾三項改善：
- 對牛肉脂肪、腎、肝、肌肉採用Codex最大殘留容許量。
- 對其他可食用內臟採用0.09 ppm的最大殘留容許量。
- 採用符合聯合食品添加物專家委員會標準的檢測方法（不使用水解步驟）。
- 協定條文：Art. 3.3 para 11-13（牛肉）、para 22-24（豬肉）。
- 農藥最大殘留容許量
- 2025年報告：批評台灣農藥最大殘留容許量審查程序中，申請人補充資料的機會有限。
- 2026年報告：新增協定承諾，台灣在尚未建立最大殘留容許量時，接受美國的容許量或Codex最大殘留容許量。
- 協定條文：Art. 3.3 para 59。
- 加工用馬鈴薯
- 2025年報告：台灣2018年起因發芽問題拒絕整船美國加工用馬鈴薯。
- 2026年報告：2026年2月台灣已採用新規定，允許發芽馬鈴薯在加工廠分揀後入境。
- 協定條文：Art. 3.3 para 53（引用2026年2月6日公佈的第1151881353號檢疫規定）。
- 豬肉原產地標示與萊克多巴胺檢測頻率
- 2025年報告：提到台灣2021年實施原產地標示要求，暗示美國豬肉有食安疑慮。
- 2026年報告：新增協定承諾，檢測頻率及標示合規檢查頻率將基於業者的合規紀錄決定。
- 協定條文：Art. 3.3 para 25-27。
- 藥品
- 2025年報告：批評健保署（National Health Insurance Administration，NHIA）定價審核缺乏透明度和可預測性。
- 2026年報告：新增協定承諾兩項：
- 接受美國食品藥物管理局（Food and Drug Administration，FDA）行銷授權作為藥品進入台灣市場的充分依據。
- 確保藥品給付定價的透明度和程序公正性。
- 協定條文：Art. 3.2.3-4。
- 醫療器材
- 2025年報告：批評自費醫材代碼審核緩慢、缺乏透明度。
- 2026年報告：新增協定承諾三項：
- 接受美國食品藥物管理局行銷授權。
- 確保給付定價透明度和程序公正性。
- 簡化自費代碼申請流程，一年內建立統一平台。
- 協定條文：Art. 3.2.3-5。
- 智慧財產權
- 2025年報告：批評線上盜版猖獗、著作權法修正案未施行、教科書侵權嚴重。
- 2026年報告：新增協定承諾三項：
- 加強智慧財產權保護，優先執法打擊盜版和商標仿冒。
- 遵循13項國際智慧財產權公約。
- 在地理標示（GI）保護方面確保透明公正，保障美國產品繼續使用被不當保護為GI的名稱。
- 協定條文：Art. 3.4（GI）、Art. 3.5（起司與肉品名稱）、Art. 3.6（智慧財產權）。
- 特別防衛措施（Special Safeguard，SSG）豁免
- 2025年報告：列出台灣對3個農產品品項實施特別防衛措施額外關稅。
- 2026年報告：明確指出協定下台灣已承諾，美國農產品不受依WTO農業協定所採取的特別防衛措施額外關稅影響。
- 協定條文：Art. 2.1.2。