高雄果菜市場北側居民於日本時代，即已世居於此，已歷兩、三代以上，而土地徵收爭議始於1970年代。
1970年，高雄市政府向省政府申請徵收民族一路，包括現在的果菜市場，以及居民居住的北側，共1萬5千坪土地；但是由於當時果菜公司政府持股僅49%，不符合當時《都市計劃法》必須公營事業才能徵收土地的規定，因而遭到駁回。
隔年（1971），市府向3名大地主取得土地，加上原本的國有地，面積達79.9%，表示已經與居民協商完成，省政府於是通過徵收案；不過，市府對居民並無安置方案，1971年至1973年間，居民不斷陳情抗議；1973年，高雄市長王玉雲與居民協商出「減半使用、半數返還」的方案，也就是果菜市場僅使用7,500坪、並承諾將另外徵收的7,500坪以各種方式還給居民，讓果菜市場得以興建。
當時，這些所謂「各種方案」，包括了興建大樓、國宅等；但是都並未落實。到了1997年，市長謝長廷研議了包括讓居民申請買回已徵收的土地、撤銷徵收、標售或專案讓售等方式，但因為謝長廷出任行政院長，這些方案也就也再延宕下來。
而目前，市府打算將「果菜市場」北移至居民現居地，據市府的說法，現在市場的地，要打造成「全新、結合滯洪功能」的批發市場；一併將十全路與覺民路打通、將促進三民區整體環境提升；市府認為，40年前，已有80％左右的地主完成補償及救濟，徵收早已完成。
不過居民反駁，所謂「80%」，是用土地「面積」來算的，所謂完成補償、救濟的，也就是當初的三名大地主，其餘的地主從未同意、也沒有領到過補償，要求市府「退回徵收、發還土地」。
2016年9月1日，高雄市政府動員大批警力強拆果菜市場北側社區，一連兩日，拆除社區內大部分的住宅。而後，雖居民持續抗爭，要求高雄市府暫停強拆，並與居民平等磋商，但高市府仍陸陸續續強拆社區內不同意自行拆遷的住戶。2016年10月27日，居民發動北上至蔡英文住宅絕食抗議，但高市府卻在當日凌晨再次強拆，將所有不同意戶的住宅拆除殆盡。
參考資料：
- 高雄果菜市場土地不義徵收自救會〈五分鐘了解果菜市場不義徵收案〉
- 2016/05/14 高雄市政府農業局 〈高雄果菜市場土地徵收牴觸戶40年爭議 市府照顧弱勢優先、保障原住戶權益、共創區域發展〉
- 2016/08/10 高雄市政府〈旗山大溝頂、高雄果菜市場、拉瓦克部落集體安置 從公共利益出發，解決數十年問題，現在不做，未來50年也無法解決〉