焦點事件記者王子豪報導
停泊於港口的漁船（攝影：王子豪）
台灣是遠洋漁業大國，並大量使用境外僱用的外籍漁工。但無論是船隻非法或規避管制的行為、或是政府掌握的能力，都一直受到民間團體的質疑，而在這次疫情中，也增添了政府監管死角的隱憂。
5月1日後，漁業署對台灣遠洋漁船的防疫規範，要求出海後，如果有靠泊外國港口、與其它船隻併船等海上接觸行為，返台後船員需要檢疫14天；不過如果船員沒有要下船入境，船隻可以在整備後直接再出海。
如何確保船隻在海上真的沒有與其它船隻併船等海上接觸情形？漁業署強調，漁船都裝有VMS（Vessel Monitoring System）漁船監控系統，如果在海上有與其它船隻併船等行為都會在監視掌握之下。
但綠色和平遠洋漁業專案主任陳珮瑜表示，VMS可以被關掉，也有人為操控的空間，例如去年就曾經訪調過一艘漁船的船員，表示該船曾有海上轉載漁貨的情形，事後詢問漁業署，漁業署卻表示，這艘漁船並沒有相關VMS的記錄。
而在人員掌握的部分，陳珮瑜表示，境外聘僱船員的情況，是由漁船回報給漁會、漁會再回報給漁業署，由於政府不是第一線、第一手掌握資訊，裡面就存在很大的操作空間。她指出，雖然台灣規定，境外僱用的船員一定要從外國港口上船，但實際上仍可能透過運搬船接駁，直接在海上進行船員的上下船。如果是在出航、返航時，透過運搬船讓境外僱用船員上、下船，中間又沒有記錄到船舶的接觸，漁業署就不會知道這名船員與船隻的關係。
境外僱用制度在疫情下，也出現了另一個過去未曾發生的問題。現在許多國家都進行境管、封閉了港口，讓原本可能計劃在返程時，延途下船的外籍船員無法直接回家。陳珮瑜表示，多數的情況還能解決，就是讓船員隨船來台，再搭飛機返國；但現在在「權宜船」上卻出現一些待解問題。
「權宜船（flag of convenience）」是指，船東將船隻的國籍掛在其它國家下。陳珮瑜直言，台灣船東把船隻掛在其它國家下，最常見的原因就是要規避台灣的法律限制，但在疫情下，卻出現了其它問題，因為船隻登記的不是台灣國籍，因此船上的境外僱用船員等於是「一艘外國船上的外國人」，技術上不同於「台灣漁船境外僱用的外籍船員」。陳珮瑜說，現在港務局和漁業署有點在互踢皮球，但這些權宜船上的外籍人士拿不到入境許可，就無法入境、也就不能搭飛機返回自己的國家，等於被卡在船上。