指揮中心在1/16、1/31、2/7公布更新過三個版本的通報條件以及病例定義。 在1/16的最初版中，臨床條件之一為「有發燒『且』急性呼吸道感染」要同時有兩種症狀。在第二版中，加嚴防疫的強度，改為「有發燒『或』急性呼吸道感染」，兩種症狀只要有一種即符合條件。 最初版中，流行病學條件中旅遊和居住史的地點只有武漢地區，之後兩次更新，逐次擴大地區的範圍。