在台鐵工作到底是不是公務人員，這關係到能不能適用《勞動基準法》。有人說是公務人員，所以休假的問題，不能比照一般勞工；有人說即便是公務人員，但同樣可以適用《勞基法》。那麼到底如何？該從哪裡下手？
首先我們要先從台鐵的性質開始說起，台鐵的全名為「臺灣鐵路管理局」，為交通部所職掌之事業機構。屬於公部門體系，並不必然導出台鐵的僱員屬於公務人員，例如政府濫用的約聘制度，他們雖然在政府部門工作，但並非法律意義上的公務「人」員。需要釐清的是，公務員與公務「人」員是不同的概念，公務員較寬廣，包含狹義的公務「人」員；公務「人」員的任用，則限定在依法考試及格、依法銓敘、升等合格，上述條件均達成才是公務「人」員。
台鐵員工雖然也經過國家考試，但是這並不直接得到他們是公務「人」員的結論。問題的癥結點在於我國公務員的晉用制度為多軌制，有所謂交通資位制與簡薦委制（一般理解的公務人員屬此類），資位制並非狹義的公務「人」員。兩者的差異包含薪資、福利、資位（官等）、退休、調任、陞遷等，以起薪來說，簡薦委制普遍高於資位制。
過去台鐵、公路總局因為獲利較佳，故採取資位制，以期留住人才，然而在簡薦委制逐年提高其待遇後，資位制的優勢不在，甚至越來越差。資位制共有六個等級，長級、副長級、高員級、員級、佐級、士級，前三者有經過銓敘部之銓敘，後三者則無。銓敘的有無，影響年資的計算，員級、佐級、士級無銓敘，轉任行政人員的話，必須從最基礎的職等開始，先前工作的年資無法累計。
確定台鐵員工是公務員而非公務「人」員，言下之意，他們不是公務人員，亦非單純之勞工，接下來的問題就是要不要適用《勞基法》了。依照《勞基法》第三條第一項第六款之規定，運輸、倉儲及通信業適用本法，但是再參照本法第八十四條之規定：「公務員兼具勞工身份者，其有關任（派）免、薪資、獎懲、退休、撫卹及保險（含職業災害）等事項，應適用公務員法令之規定，但其他所定勞動條件優於本法所規定者，從其規定。」
上開條文中的公務員兼具勞工身份者，為我國所獨創，依據《勞基法施行細則》第五十條，但其他所定勞動條件，則指工作時間、休息、休假、安全衛生、福利、加班費等。從上述條文內容，可知台鐵員工為公務員兼具勞工身份者，其勞動條件，應回歸勞基法所訂之標準。
總而言之，台鐵員工依據不同資位，在轉調行政單位上，可能產生法律適用上不同的結果。然而無論如何，台鐵的員工的身份都是公務員兼具勞工身份，根據勞基法相關規定，公務員兼具勞工身份者，其勞動條件若未優於勞基法，應適用勞基法之規定，故原則上，關於工時、休假、排班等規定，應該遵守勞基法之指示。
另外根據《公務人員週休二日實施辦法》第四條第一項之規定，交通運輸機構雖然全年無休，但是仍應實施輪休、輪班制度，以期落實公務員每周休息日數（公務員服務法第十一條立法理由參照）。