藻礁公投推動聯盟在2021年11月16日，發表三接遷址至台北港的評估（報導）。過去台北港方案，被中油、經濟部以「要11年、來不及」等理由回絕不可行；但藻礁團隊則提出了預估僅需5.5年即可啟用的方案，在時程上與留在大潭的「外推方案」相近。
官方版台北港、與民間版台北港，兩方案所需建置時間相差一倍，主因是官方版的台北港需填海造陸；藻礁團隊則認為可直接使用台北港N7~N9碼頭區域，免除填海造陸所需的調查與工程時間。
N7~N9現況
台北港由台灣港務公司基隆分公司經營，台北港的北碼頭區，即N3~N9碼頭與後方的第一貨櫃儲運中心土地等，通過BOT契約給台北港貨櫃碼頭股份有限公司開發。
藻礁聯盟指出，貨櫃碼頭公司至今實際上只建設了N3~N6碼頭區域，N7~N9目前只有部分空間短期租給製造三接沉箱的公司。藻礁聯盟表示，N7~N9沒有依合約興建碼頭及營運設施，而有履約爭議、正在協商中；且合約中，原本就允許政府因政策等原因，終止相關的特許權利。因此認為N7~N9碼頭區域，有實際上是可以使用的。
時程推估
經濟部表示，三接遷址台北港需11年，主因是需要另外填海造陸。包括前置的環境調查、地質鑽探等3年；填海造地、碼頭、防波堤等4年；儲槽、管線、氣化等設施4年。
藻礁聯盟的方案中，不需填海造陸。估計約需5.5年，包括前置作業為1.5年（政府政策更，計畫報核，撒銷N7~N9營運許可，終止契約約3個月；協商投資契約，3到6個月；環差或環評，依台北港南外堤內側碼頭填海造陸環差半年估計，約6~12個月）；港灣及造地工程0年（N7~N9已完工）；儲槽輸氣管氣化設備工程4年（依經濟部同樣時間） 。
行政院在5月3日公布的三接外推方案，預計在2025年6月供氣；因此5.5年的台北替代方案，仍可能會再晚一點。但藻礁盟指出，大潭電廠7~9號機組都會在2025年之前啟用，表示政府有短期的調度方案，認為三接台北港方案再晚一點點的時間差，對整體能源供應衝擊不大。
額外優勢
藻礁聯盟認為，台北港方案比外推方案有更多優點。外推方案僅有2座共32萬公秉的儲槽，且不具擴建空間；台北港方案中，N9碼頭區域即可興建4座共72萬公秉儲槽，整合N7、N8區域後，估計可蓋6~7座儲槽，或是將目前在東碼頭、鄰近社區的47座油槽外移遠離居民。
台北港風浪較小，能更安全穩定的供氣，尤其在冬季，不會有大潭海相不佳、恐影響中南部減媒的可能。
藻礁聯盟也期待台北港方案，可以把同樣正在爭議中的基隆協和四接整併起來。
經濟部與交通部的回應
2021年11月16日，經濟部與交通部都發布新聞稿回應，認為藻礁聯盟所提方案不可行。
經濟部維持過去相同的說法，並沒有回應藻礁聯盟具體提出的規劃。回應內容包括：「台北港需11年」、「新北市政府、民代反對」、「沒有做環評」「管線會影響藻礁」、「台北港繁忙、需經航安評估，無法武斷推定可行」。
交通部則表示，港務公司與貨櫃碼頭公司近期對N7~N9碼頭已有初步共識將繼續發展，預計2021年底前可定案推動；LNG船航行、停泊時需與其它船保持距離，會影響其它船等。